Den femte og avsluttende etappen i Vuelta a Burgos var også den tøffeste. Flere tøffe stigninger var lagt inn på de siste seks milene, som ble avsluttet med stigningen opp til Lagunas de Neila (7,5 kilometer à 8 prosent).
Lluís Mas (Caja Rural) kom inn i bakken med en liten luke til feltet, anført av Movistar. Spanjolen ble hentet inn seks kilometer fra mål, og like etter kom de første angrepene fra favorittene fra Gianluca Brambilla (Etixx-Quick Step).
Den første som fikk en virkelig luke var imidlertid Sergio Pardilla (Caja-Rural). 32-åringen angrep drøyt fire kilometer fra toppen, og fikk raskt en luke på 15 sekunder.
Til tross for at ryttere som Alberto Contador (Tinkoff) og Adam Yates (Orica-BikeExchange) satt i gruppa bak, økte avstanden til 50 sekunder da det gjenstod to kilometer.
Inn mot den siste kilometeren angrep Ben Hermans (BMC), og fikk følge av Contador. De to var henholdsvis 22 og 18 sekunder foran Pardilla i sammendraget før etappen, og de hadde dermed muligheten til å ta sammenlagtseieren, selv om de var sjanseløse på å hente igjen Pardilla.
500 meter før mål angrep Contador på ny, og han fikk umiddelbart en luke til Hermans.
Pardilla vant etappen klart, og dermed startet noen spennende sekunder i målområdet. Contador kom i mål 17 sekunder bak Pardilla, men var selv bare fire-fem sekunder foran Hermans igjen.
Etter å ha forsikret seg om at de hadde fått det riktige resultatet, ble Hermans dømt i mål 22 sekunder bak Pardilla. Dermed vant Contador sammenlagt, sekundet foran Hermans og Pardilla.
